Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm6880A3KG45 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm6880A3KG45 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm6880A3KG45 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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