Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lcn6A2AJB9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms