Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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