Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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