Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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