Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms