Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Med27Q9DB40 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Med27Q9DB40 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Med27Q9DB40 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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