Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms