Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms