Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms