Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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