Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf17Q99MV7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf17Q99MV7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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