Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms