Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms