Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Q8BGC1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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