Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC159203.1-201ENSMUST00000222039 769 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 A730032A03Rik-202ENSMUST00000143202 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ClmQ7TSN2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms