Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms