Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms