Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms