Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Ccdc18Q640L5 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Ccdc18Q640L5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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