Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm6555-201ENSMUST00000195167 789 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Lrrc43Q3V0L5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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