Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms