Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd2Q149F1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms