Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ttc39dQ0VF76 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ttc39dQ0VF76 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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