Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms