Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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