Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 1700017D01Rik-201ENSMUST00000025635 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm11565-201ENSMUST00000105053 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 4930579M01Rik-201ENSMUST00000130943 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tnip3-208ENSMUST00000212402 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms