Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms