Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme1P97371 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme1P97371 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme1P97371 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme1P97371 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme1P97371 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme1P97371 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme1P97371 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme1P97371 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme1P97371 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme1P97371 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms