Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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