Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ube2k-207ENSMUST00000202082 4506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csrnp3P59055 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms