Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms