Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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LtbrP50284 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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