Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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