Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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