Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usp4P35123 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usp4P35123 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms