Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms