Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms