Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3002E9PW72 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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