Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Zbed5B2RPU8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Zbed5B2RPU8 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms