Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms