Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Robo3Q9Z2I4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms