Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms