Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms