Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Trim39Q9ESN2 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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