Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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