Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gtf3c6Q9D8P7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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