Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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