Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Wdr55Q9CX97 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Wdr55Q9CX97 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms