Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms